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生物除臭工藝是一種安全可靠的臭氣處理方法，除臭效率大于90%。其原理是污泥處理過程中所產生的臭氣經收集系統收集后集中送至生物濾池除臭裝置處理，臭氣通過濕潤、多孔和充滿活性微生物的濾層，利用微生物細胞對惡臭物質的吸附、吸收和降解功能，微生物的細胞個體小、表面積大、吸附性強、代謝類型多樣的特點，將惡臭物質吸附后分解成CO2、H2O、H2SO4、HNO3等簡單無機物。

微生物除臭過程分為三步：

（1）臭氣同水接觸并溶解到水中；

（2）水溶液中的惡臭成分被微生物吸附、吸收，惡臭成分從水中轉移至微生物體內；

（3）進入微生物細胞的惡臭成分作為營養物質為微生物所分解、利用，從而使污染物得以去除。

微生物分解惡臭成分的化學反應式

a. 硫化氫

H2S+202→H2SO4

b. 甲硫醇

2CH3SH+7O2→2H2SO4+2CO2+2H2O

c. 硫化醇

(CH3)2S+5O2→H2SO4+2CO2+2H2O

d. 二甲二硫

2(CH3)2S2+13O2→4H2SO4+4CO2+2H2O

e. 氨

NH3+2O2→HNO3+H2O

f. 三甲胺

2(CH3)3N+13O2→2HNO3+6CO2+8H2O

從以上的反應所示，臭氣成分會分解成二氧化碳，水和硫酸、硝酸等酸性物質，適當的散水能沖掉這些酸性物質，以保持適當的微生物生長的環境。

微生物除臭是利用微生物細胞對惡臭物質的吸附、吸收和降解功能，對臭氣進行處理的一種工藝。主要過程如下：通過收集管道，抽風機將臭氣收集到生物濾池除臭裝置；經過填料微生物的吸附、吸收和降解，再通過活性炭吸附，將臭氣成分去除。